Музей основан в 1906 году главой православной миссии игуменом Иринархом, в миру – Иваном Шемановским. За 115 лет фонд учреждения пополнили более 200 тысяч экспонатов самобытной истории Ямала. Сегодня крупнейший комплекс успешно сочетает традиции и современность, реализует смелые выставки и масштабные проекты. В июне 2021 года коллектив МВК им.Шемановского был награжден знаком отличия «Достояние Ямала». Сотрудников одного из старейших музеев в Западной Европе поздравил секретарь реготделения партии «Единая Россия» Алексей Ситников .
«За более чем вековую историю коллективу музея удалось сохранить прошлое Севера для будущих поколений. Деятельность крупного научного, просветительского центра направлена на воспитание любви к родной земле, уважение к традициям. Об этом свидетельствуют расширение выставочной деятельности, активное участие в различных программах в сфере культуры, развитие тесного сотрудничества со многими музеями и научными учреждениями Ямала, России и зарубежья. Спасибо вам за добросовестный труд, любовь и преданность северной земле. Желаю всему коллективу крепкого здоровья, семейного благополучия и вдохновения. Музею – процветания и новых интересных проектов!», – поздравил коллектив МВК им.Шемановского Алексей Ситников.